Bioinformatik

Sie suchen

In medizinischen und biologischen Un­ter­su­chun­gen werden eine Vielzahl von Daten erhoben, durch die signifikante Wirk­me­cha­nis­men gefunden werden sollen.

Dabei kann es sich um Studien mit einem großen Patientenkollektiv oder um "omics"-Daten (Hochdurchsatzmessungen von Genen, Tran­skrip­ten, Proteinen,...) handeln. Die Anwendungen liegen meist im medizinischen Bereich, wobei Diagnose- und Therapieverfahren sowohl für den allgemeinen Fall als auch für einzelne Patienten (Stichwort "Individualisierte Medizin") gefunden oder verbessert werden sollen.

Für solche Fälle wird die Bioinformatik eingesetzt, ein Bereich, in dem auf biologische und medizinische Daten angepasste Methoden (der Mathematik und In­for­ma­tik) entwickelt werden. Zwar haben die meisten ihren Ursprung in der Statistik und Datenanalyse, jedoch gibt es Weiter- und Neuentwicklungen für einen Einsatz in den Lebenswissenschaften (engl. Life Sciences). Dabei ergänzen sich bioinformatorische Methoden mit denen der Sys­tem­bio­lo­gie.

Ein weiterer Schwerpunkt ist die Stan­dar­di­sie­rung, An­no­tie­rung und Ver­wal­tung dieser großen Datenmengen.

Wir bieten

Das interdisziplinäre Team von BioControl setzt bioinformatorische Methoden gezielt in der Grundlagenforschung und in An­wen­dungs­ge­bie­ten wie der Me­di­zin­tech­nik ein. Als Beispiele sind die Analyse von Gen­ex­pres­sions-, Proteom- oder Pa­tien­ten­da­ten zu nennen. Durch statistische Test­ver­fah­ren können Aussagen über die Signifikanz bestimmter Effekte getroffen werden.

So kann analysiert werden, welche Gene und Proteine bei äußeren Veränderungen oder genetischen Unterschieden differentiell exprimiert sind. Anschließend kann mit weiteren Testverfahren oder Methoden zur Netzwerkinferenz untersucht werden, wie diese Gene und Proteine interagieren oder an welchen biologischen Funktionen sie beteiligt sind. Damit stark verbunden ist die Bestimmung von Biomarkern (qualitativ oder quantitative Diagnosesysteme) oder von spezifischen, gezielten Therapien.

Auf ähnliche Weise können auch medizinische Diagnose- und Therapieverfahren bewertet werden. So können alternative Mess­ver­fah­ren gefunden werden, die eine Verringerung des Aufwandes (Kosten, Eingriff,...) erreichen oder verbesserte Re­sul­ta­te erzielen.

Ein weiterer Schwerpunkt unserer Firma im Bereich der Bioinformatik ist die Ver­wal­tung von biologischen und medizinischen Daten. Dabei werden angepasste Lösungen für die Speicherung (in Form von Da­ten­ban­ken) und den Nutzerzugriff angeboten.

Anwendungen

  • Omics-Analyse (z. B. Immunantwort auf Infektionen)
  • Promotor-Analyse (Untersuchung von Bindestellen anhand von ChIP-Seq Daten)
  • Datenverwaltung (Standardisierung, Annotierung, Datenbanken, Nutzer-Interface)
  • Interaktionsnetzwerke
  • Sequenzanalyse (Mapping)
  • Bestimmung evolutionärer Beziehungen